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ダイナミクスを考慮した膜蛋白質の構造モデリング

概要

  • バイオインフォマティクスと分子シミュレーションの最新技術を結合し、以下の目的の達成を目的とした研究を行っています。
  1. 脂質二重膜中での膜タンパク質の構造安定化機構の解明
  2. 動的で大規模な構造変化を起こしやすい領域の予測とそれを考慮したモデリング技術の確立
  3. 膜タンパク質複合体の立体構造モデリングへの具体的応用

外部資金

最近の成果

HTM-ONE   
MultiCoMP

共同研究者

  • 杉田有治（理研）
  • 岡本祐幸（名古屋大）
  • 森博幸（京大）

ソフトウェア & データベース

論文・書籍

2010

  1. Ahmad, S., Singh, Y. H., Paudel, Y., Mori, T., Sugita, Y., & Mizuguchi, K. (2010). Integrated prediction of one-dimensional structural features and their relationships with conformational flexibility in helical membrane proteins. BMC Bioinformatics, 11, 533. doi

ﾆｭｰｽ

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発表

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@archer_jpn