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タンパク質-タンパク質間相互作用の予測

1. アミノ酸配列からのタンパク質間相互作用予測
PSOPIA

ツール:PSOPIA

2. 単一アミノ酸配列からのタンパク質結合部位予測

ツール:PSIVER

3. アミノ酸配列ペアからのタンパク質結合部位予測

ツール:PPiPP

ソフトウェア & データベース

論文・書籍

2015

  1. 水口賢司 (2015). タンパク質間相互作用「生命ネットワークの基本部品の構造を解明する」 日本生物物理学会, .

2014

  1. Murakami, Y., & Mizuguchi, K. (2014). Homology-based prediction of interactions between proteins using Averaged One-Dependence Estimators. BMC Bioinformatics, 15, 213. doi

2011

  1. Ahmad, S., & Mizuguchi, K. (2011). Partner-Aware Prediction of Interacting Residues in Protein-Protein Complexes from Sequence Data. PLOS ONE, 6(12), e29104. doi

2010

  1. Murakami, Y., & Mizuguchi, K. (2010). Applying the Naïve Bayes classifier with kernel density estimation to the prediction of protein–protein interaction sites. Bioinformatics, 26(15), 1841–1848. doi

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